Одеський медичний інститут Міжнародного гуманітарного університету був створений у січні 2009 року. Після процесу підготовки та оформлення документів була отримана ліцензія на надання освітніх послуг навчальними закладами, пов’язаних з одержанням вищої освіти на рівні кваліфікаційних вимог до фахівця.
Перша ліцензія в галузі знань 1202 «Фармація» для підготовки фахівців за спеціальністю «Технологія парфумерно‑косметичних засобів» отримана на 25 осіб. В основу навчального процесу було взято затверджені навчальні програми Міністерства освіти та науки України та Міністерства охорони здоров’я України. Перший набір був здійснений в 2010/11 навчальному році і в 2011 році отримана ліцензія на підготовку бакалаврів за спеціальністю «Фармація» на 50 осіб. Відповідно до навчальної програми було сформовано кілька напрямків (загальна і клінічна фармакологія, технологія лікарських засобів, медична хімія, біологія та фармакогнозія) і створена кафедра загальної та клінічної фармакології.
Директором Одеського медичного інституту та медичного коледжу Міжнародного гуманітарного університету з перших днів заснування була при‑ значена д. м. н., проф. Галина Петрівна Пекліна, яка протягом 7 років очолювала інститут та коледж.
У 2012 році було отримано ліцензію на підготовку фахівців за спеціальністю «Стоматологія» на 25 осіб. Було створено кафедру загальної стоматології, яку очолила д. м. н., проф. Людмила Петрівна Зубкова. У грудні 2016 року Одеський медичний інститут Міжнародного гуманітарного університету очолив к. м. н., доц. Віталій Григорович Шутурмінський.
